Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTK7Q13308 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTK7Q13308 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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