Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANK3Q12955 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms