Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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