Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms