Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC3A1Q07837 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms