Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP7AQ04656 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms