Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TUBB4BP68371 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms