Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms