Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms