Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms