Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms