Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERFP50548 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERFP50548 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERFP50548 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERFP50548 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms