Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms