Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARGP37231 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARGP37231 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms