Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD38P28907 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD38P28907 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD38P28907 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD38P28907 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms