Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms