Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSRP1P21291 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms