Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms