Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDSP20132 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDSP20132 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDSP20132 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDSP20132 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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