Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB4P16144 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms