Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms