Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3P10147 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms