Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM58BPP0C7Q3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms