Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXB7P09629 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB7P09629 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms