Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3P08700 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3P08700 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3P08700 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms