Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms