Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDRT1O95170 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDRT1O95170 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDRT1O95170 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms