Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms