Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TO15178 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TO15178 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TO15178 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TO15178 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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