Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGPD8O14715 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD8O14715 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms