Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRPO00591 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms