Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN8O00124 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms