Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER2I3L3R5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms