Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEMP2A6NFY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEMP2A6NFY4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms