Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms