Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF13BQ9Y275 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms