Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POMPQ9Y244 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms