Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
L1RE1Q9UN81 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms