Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF3Q9ULT6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms