Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED13Q9UHV7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms