Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX1-2Q9UD57 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms