Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms