Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms