Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NLKQ9UBE8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms