Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFIP11Q9UBB9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFIP11Q9UBB9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms