Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms