Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms