Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms