Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP1Q9C000 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP1Q9C000 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms