Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms